民進黨在這次大選中，濁水溪以南攻占全部的立委席次，南北發展失衡的議題，再度浮出檯面，台南市長賴清德主張，除了行政院部會和立法院應往中南部遷移外，總統府也要搬到台南，台北應變成經濟中心，國民黨中常委謝龍介也支持賴清德的看法。
賴清德籲遷都台南 藍營支持，您怎麼看？
賴清德是在18日主持謝票記者會時，有媒體問他有關於行政院部會是否應該南遷時？他提出，國民黨長期執政，台灣發展重北輕南，導致南北失衡，他認為，部會南遷可帶動台灣各地均衡發展，這是自他擔任立委以來，就堅持的主張，是媒體問及，才又再度提起這項主張，並非是趁此次大勝，才特別向蔡英文反映。
賴清德表示，目前中央政府許多部會機關，都在台北承租辦公大樓，單是這些「流浪部會」，一年就要花掉10多億元租金，非常浪費錢，這也是他從立委開始，到現在都一直堅持中央許多部會應該南遷的原因，如果把台北定位為台灣經濟中心，中部為行政中心，南部是政治中心，才有辦法解決區域平衡的問題。
賴清德解釋說，台中的省議會就是立法院，省政府就是行政院，加上100多年前的總統府本來就在台南，如果能將總統府和部分部會遷回台南，就能帶動各地均衡發展，台南的土地多的是，看要設在高鐵附近，或是另外規畫一個總統府特區，隨時都找得到地。
此外，賴也主張，行政院部會也可結合當地特色往中南部遷移，例如勞委會設高雄、環保署移到南台灣、文化部在台南，最好的地點就是高鐵站附近，因為台灣早已經一日生活圈，部會南遷移是平衡台灣南北發展的一個很好的做法。
台南市議會國民黨團書記長蔡育輝、中常委謝龍介，也都支持賴清德的主張，蔡、謝兩人都認為，台南這次用全國最高的得票率支持蔡英文，加上下一屆立法院民進黨席次過半，民進黨已經完全執行，要把總統府遷到台南，有利於台南發展，民進黨應該說到做到，不要只是喊喊口號而已。